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pH 기울기 감지를 이용한 이온 의존성 합성 유전자 회로의 동역학적 설계

본 주제는 세포 내 다양한 구획(예: 세포질, 리소좀) 간의 pH 기울기 변화를 직접적으로 감지하여 특정 유전자 발현을 조절하는 합성생물학 적 회로 설계 원리를 다룹니다. 회로 구성 원리 특정 pH 범위에서 활성화되는 pH 민감성 프로모터를 이용하여 외부 환경 변화를 …

2일 전 6 aginglab
알로스테릭 조절

알로스테릭 조절 이란 효소나 다른 생체 분자가 활성 부위가 아닌 다른 위치, 즉 알로스테릭 자리 에 결합하는 작은 분자(알로스테릭 조절자)에 의해 그 기능이 변형되는 현상을 말합니다. 작동 원리 알로스테릭 조절자는 효소의 구조적 변화를 유도하여 효소 반응 속도 를 증가…

2일 전 8 aginglab
대사체-전사체 통합 분석

대사체-전사체 통합 분석 대사체-전사체 통합 분석 은 세포 내에서 일어나는 유전자 발현 수준(전사체)과 실제 생성되는 저분자 물질(대사체) 간의 관계를 동시에 규명하는 다중 오믹스 접근법이다. 이는 단순히 각 데이터셋을 개별적으로 분석하는 것을 넘어, 전사 활동 변화가…

2일 전 7 aginglab
대사체 신호 기반의 염색질 리모델링 복합체(CRM)의 알로스테릭 조절 모델링

본 주제는 세포 내 다양한 대사체 신호 가 어떻게 염색질 리모델링 복합체 의 기능을 알로스테릭 방식으로 조절하여 유전자 발현 패턴을 시스템적으로 제어하는지를 모델링하는 분야이다. 핵심 조절 메커니즘 특정 대사 중간체 농도의 변화가 CRM 구성 요소의 결합 친화도에 영향…

2일 전 5 aginglab
종양미세환경

종양미세환경(Tumor Microenvironment, TME)은 암세포 주변에 존재하는 복잡하고 역동적인 세포 및 비세포 성분들의 총체를 의미합니다. 이는 종양의 발생, 성장, 전이 및 치료 반응에 결정적인 영향을 미치는 환경입니다. TME의 구성 요소 면역세포 침윤…

2일 전 6 aginglab
PCA

주성분 분석(Principal Component Analysis, PCA)은 고차원 데이터에서 가장 분산이 큰 방향을 찾아 차원을 축소하는 비지도 학습 기법입니다. 핵심 개념 PCA의 목표는 데이터의 정보 손실을 최소화하면서 변수의 개수를 줄이는 것입니다. 데이터의 분…

2일 전 5 aginglab
CCA

CCA는 일반적으로 여러 분야에서 다양한 의미로 사용될 수 있으나, 과학 및 기술 맥락에서는 주로 특정 화학 물질이나 시스템을 지칭합니다. 주요 의미 화학적 맥락: 특정 유기 화합물이나 반응 경로를 나타낼 때 사용됩니다. 생물학적 맥락: 세포 신호 전달 경로 등 생명 …

2일 전 2 aginglab
단일세포 공간 전사체학 데이터에서 세포 간 통신 네트워크 추론을 위한 그래프 이론적 접근법

단일세포 공간 전사체학 데이터는 세포의 공간적 맥락 정보를 제공하며, 이를 통해 세포 간의 상호작용 네트워크를 구축할 수 있습니다. 이 분야에서는 복잡한 생물학적 관계망을 수학적으로 모델링하기 위해 그래프 이론 적 방법론이 필수적으로 사용됩니다. 네트워크 추론의 기본 …

2일 전 2 aginglab
공간 전사체학 기반의 리보핵단백질(RNP) 복합체-세포막 도메인 상호작용 지도화

본 주제는 공간 전사체학 기술을 이용하여 특정 세포 내 리보핵단백질(RNP) 복합체 들이 세포막의 특정 도메인 과 어떻게 상호작용하며 기능을 수행하는지를 시각적으로 규명하는 분야이다. 연구 목표 특정 유전자 발현 단계에 관여하는 RNP 복합체의 세포 내 국소화 패턴을 …

2일 전 2 aginglab
지질 대사 산물에 의한 미토콘드리아 막 잠재력 조절 메커니즘

본 주제는 세포 내 지질 대사 산물 이 어떻게 미토콘드리아 막 잠재력(MMP) 의 동역학적 변화를 유도하여 세포 에너지 항상성을 조절하는지를 탐구한다. 핵심 조절 기전 특정 스핑고지질 과 같은 지질 대사체가 미토콘드리아 외막 단백질과의 상호작용을 통해 MMP의 안정성을…

2일 전 2 aginglab
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